vConTACT3: 机器学习实现可扩展和系统的病毒层级分类

张开发
• 2026/4/17 8:00:32 • 15 分钟阅读

最新文章

推荐文章

相关文章

分享文章

vConTACT3: 机器学习实现可扩展和系统的病毒层级分类
https://www.nature.com/articles/s41587-025-02946-9https://bitbucket.org/MAVERICLab/vcontact3/src/master/安装mamba create --name vcontact3 python3.10 mamba activate vcontact3 #Or 最新版 cd Software git clone https://bitbucket.org/MAVERICLab/vcontact3.git cd vcontact3 python -m pip install . #数据库下载 wget -O v232.tar.xz https://zenodo.org/api/records/19198397/files/v232.tar.xz/content tar xf v232.tar.xz #环境安装 mamba install -c bioconda --file requirements.txt python -m pip install --no-deps .使用vcontact3 run \ -n All_100_vOTU_95_v2.fa \ -d /home/zhongpei/hard_disk_sda2/zhongpei/Software/vcontact3/ \ --db-version 232 \ -t 90 \ -f \ --quiet \ -e cytoscape

更多文章